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單堿基編輯實驗
簡要描述：
單堿基編輯實驗是一種基于CRISPR系統(tǒng)的精準基因編輯技術(shù)，可在不誘導DNA雙鏈斷裂（DSB）的前提下，直接實現(xiàn)基因組中單個堿基的定向轉(zhuǎn)換。其核心突破在于規(guī)避了傳統(tǒng)CRISPR-Cas9依賴的DSB修復路徑（如易出錯的NHEJ），顯著提升編輯安全性與精確度。
更新時間：2025-07-24
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廠商性質(zhì)：其他
一、單堿基編輯實驗技術(shù)定義與核心突破
單堿基編輯是一種基于CRISPR系統(tǒng)的精準基因編輯技術(shù)，可在不誘導DNA雙鏈斷裂（DSB）的前提下，直接實現(xiàn)基因組中單個堿基的定向轉(zhuǎn)換。其核心突破在于規(guī)避了傳統(tǒng)CRISPR-Cas9依賴的DSB修復路徑（如易出錯的NHEJ），顯著提升編輯安全性與精確度。
生物學意義：58%的人類遺傳性疾病由單堿基突變（SNVs）引起，該技術(shù)為這類疾病提供了革命性治療策略。
二、分子機制與核心組件
1. 編輯原理
單堿基編輯通過融合催化失活的Cas9蛋白（dCas9或切口酶nCas9）與堿基脫氨酶，形成復合物實現(xiàn)對目標堿基的定向修改：
脫氨反應(yīng)：脫氨酶將特定堿基轉(zhuǎn)化為中間產(chǎn)物（如胞嘧啶→尿mi啶，腺嘌ling→次黃嘌ling）。
細胞修復：DNA修復機制將中間產(chǎn)物轉(zhuǎn)化為目標堿基（如尿mi啶→胸腺嘧啶，次黃嘌ling→鳥嘌ling）。
2. 編輯流程
3. 編輯窗口
受sgRNA與PAM序列限制，有效編輯窗口通常為4-8個堿基（窗口位置因編輯器類型而異）。
染色質(zhì)結(jié)構(gòu)（如異染色質(zhì)區(qū)）可能降低編輯效率。
三、編輯器類型與技術(shù)演進
1. 主流編輯器分類
| 類型 | 脫氨酶 | 堿基轉(zhuǎn)換 | 技術(shù)里程碑 | 優(yōu)化策略 |
|---|---|---|---|---|
| 胞嘧啶堿基編輯器（CBE） | APOBEC1/CDA/AID | C→T / G→A | 2016年David Liu團隊開發(fā)（BE1-BE4） | 融合UGI抑制尿mi啶糖基化酶 |
| 腺嘌ling堿基編輯器（ABE） | TadA+ | A→G / T→C | 2017年David Liu團隊開發(fā) | 工程化TadA*7.10高活性變體 |
| 鳥嘌ling堿基編輯器（GBE） | 胞嘧啶脫氨酶+UNG | C→G / G→C | 2021年Zhao等開發(fā) | 聯(lián)合糖基化酶促C→G轉(zhuǎn)換 |
| 先導編輯器（PE） | 逆轉(zhuǎn)錄酶+切口酶nCas9 | 多堿基編輯 | 2019年Anzalone等開發(fā) | pegRNA設(shè)計優(yōu)化編輯范圍 |
2. 關(guān)鍵創(chuàng)新
編輯效率提升：
引入UNG抑制蛋白（如UGI），阻止尿mi啶被錯誤修復，使CBE效率提高3倍。
雙AAV載體遞送系統(tǒng)解決大片段編輯器包裝難題（如PE系統(tǒng)>6kb）。
脫靶控制：
高保真Cas9變體（HypaCas9）降低非特異性結(jié)合。
RNA脫靶抑制劑（如SECURE-BE）阻斷編輯器與游離RNA結(jié)合。
單堿基編輯實驗
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